La sezione Strumenti ospita una pagina dedicata alla Bibliografia generale, preceduta dalle Bibliografie già edite, ai RIS, una pagina dedicata al periodico edito dal Centro studi muratoriani: Muratoriana, pubblicato dal 1950 al 1988, che idealmente continua nel nuovo titolo:Muratoriana online.

Non mancano un Notiziario di aggiornamento e una pagina dedicata ai maggiori siti di interesse muratoriano.